智財技轉中心的組織架構包括中心主任一名，現由本校化學工程系曾堯宣副教授擔任，資深經理一名，負責技術媒合洽談、專利授權、讓與業務推動、專利授權暨技術移轉相關業務進度控管及推動中心政策。下轄兩個組，一為專利組，聘有兩名智權管理師，主要的工作是專利申請、檢索、維護、讓與及終止維護等業務；二為技轉組，聘有一名技術推廣經理與兩名智權管理師，技推經理主要工作是針對本校具有競爭力的專利和智財商品，進行專職化服務和推廣（專利授權、技術授權、產學合作），智權管理師主要負責技轉程序處理，包含協助本校教師媒合技術移轉及產學合作案件，諮詢服務、商談條件、合約審閱修訂、簽約請款及合約追蹤管理、歷年應收未收帳款催款等事項，以提升技轉績效與行政效率。